El Centro está conformado por seis plataformas de investigación científica, tecnológica y de innovación (P-ICTI), a saber:
Planta baja:
P-ICTI-2 Producción de unidades de semilla (US) y unidades de producción sembradas para cosechar (UPSC) de hongos comestibles, funcionales y medicinales.
Primer piso:
P-ICTI-1 Recursos genéticos de hongos comestibles, funcionales y medicinales.
P-ICTI-3 Productos biotecnológicos con impacto en la salud humana, a partir de los hongos comestibles, funcionales y medicinales.
P-ICTI-4 Producción de inóculo de huitlacoche.
P-ICTI-5 Bioterio, investigación científica básica y aplicada utilizando modelos in vivo.
P-ICTI-6 Sala de vinculación en línea con la sociedad, en tiempo real, utilizando medios digitales.